Panty(小笠原亚里沙 配音)和Stocking(伊濑茉莉也 配音)本是两位天使,却因为他们桀骜不驯的作风而被逐出了天堂,来到了堕天城。在这里,姐妹两人遇见了名为Garterbelt(石井康嗣 配音)的神父,在这位拥有着神秘过去的神父的带领下,Panty和Stocking成为了恶灵狩猎者,通过狩猎恶灵得到天堂金币,当天堂金币积攒到了一定的数量之时,Panty和Stocking便可以借此重新返回天堂。就这样,两人在堕天城的日常就此拉开了序幕。
日本防卫省特种部队的精英内岛维辰(木佩·希娜饰)向学生们介绍了这种怪物。他拥有20马赫的超高速,人类的普通武器对他没有任何影响。为了防止怪物在一年后阴谋毁灭地球,人类必须想办法消灭他。而怪物自愿担任E班的班主任长达三年,因此无能为力的学生承担起了刺杀怪物的责任。之后,学生们接受了内岛的严格训练,刺客碧姬(Kei饰演)、智能机器人自主思考固定炮塔(桥本春奈饰演)、转学生森荷里(Kato Keishiro饰演)和教官秋原明(Takashima Masahiro饰演)等强大对手也纷纷来到这个暗杀教室,离奇的“杀害老师”将面临无休止的暗杀行动。。。这部电影改编自松井有政的流行漫画。