2021年7月26日,佐伯照生(池松壮亮 饰)迎接34岁生日,起床后惯常地为仙人掌浇水,身体随着收音机音乐摆动,就算是生日,身为灯光师的他仍如常工作,照亮台上每一位舞者。同一天,的士司机叶(伊藤沙莉 饰)驾驶着的士在疫情下的东京夜路上行驶。
2048年,经过中央政府管理的人工智能筛选,一部分人类登上星际迁徙飞船“阿拉姆”,前往11.9光年外的鲸鱼座τ星E的旅程。然而,人类花了20年时间到达的这颗行星与地球之间的环境差距远超预期,使其不适合人类生存。移民飞船上有一个叫庆雄的年轻人。4岁时,他目睹了自己的父母被哥斯拉杀死。20年来,他一直想回到地球,摧毁哥斯拉。移民的可能性已经消失,飞船内部的生活环境变得越来越恶劣。以Haruhiro为中心的“重返地球派”已经成为主流,他们决定通过危险的长途子空间航行重返地球。然而,经过2万年的进化,地球已经形成了以哥斯拉为顶点的生态系统,完全成为了一个未知的世界。人类最终能夺回地球吗?庆雄的命运会怎样?