“学园市”有230万人口,其中80%是学生,是一个技术比其他地区更先进、从事“超级大国发展”的特殊地区。然而,整个校园城只有七个人的五级超能力之一木坂美佐木,由于她的能力和个性,参与了校园城发生的各种事件麻原素子(坂本正也配音)目前是公安9号少校,他听从部门负责人荒仓大辅(小林光一配音)的指示,前往调查一架运输机的神秘合并。结果,他在途中遭到巴特(松田贤一郎配音)领导的武装武装分子的袭击。与此同时,全国各地的交通管制系统也出乎意料地崩溃了。