三人回忆起小学时光,约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里,他们居然遇到了归国的松冈凛(宫野真守 配音)。意料之外的是,昔日战友凛性情大变,还对遥发起挑战,结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部,经过多番努力后,终于招募到了新成员龙崎怜(平川大辅 配音),他们以县大赛冠军为目标,进行紧张的集训。另一方面,凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定,要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部,在这个夏天,开始了关于友情与青春的Free!故事。
有一段时间,政治、广播等行业的几位知名公众人物惨遭杀害,现场无一例外地留下了莫名其妙的字母和数字组合。经过一番推理,杉下佑静(水谷裕太饰)得出结论,这些符号来自国际象棋手册。
于是,一些有特殊能力能够杀死神灵的少年和少女们出现了,我们称他们为弑神者。 草薙护堂(松冈祯丞 配音)是一个普通的高中生,一次偶然中,他打败了军神继承了他的能力,从此,一条弑神的道路在护堂面前展开了。与此同时,少女艾丽卡(日笠阳子 配音)、巫女万里谷祐理(花泽香菜 配音)、艾丽卡的好友利利亚娜(喜多村英梨 配音)等人也都逐渐发现了自己的能力,随着战斗的深入,他们发现,单打独斗绝非正道,只有团结起来,利用优势隐藏劣势,才有可能战胜那最后的,最可怕的,也是最强大的敌人。