在一个瓢泼大雨的夜晚,一名年轻女子死于一场车祸。当吉隆吉隆(木村拓哉饰演)和正木昭(北川惠子饰演)对肇事司机进行例行询问时,大阪地方检察厅南波分院检察官竹谷由美(松田孝子饰演)意外出现在吉隆面前。
这个被称为“疫苗世界”的地方在维度上与地球不同,是一个和平稳定的世界,四季如春。有一天,被封在那里的病毒之王“黑暗恶魔”逃跑了,朝着地球的方向逃跑。被这件事困扰的疫苗行业女神玛雅命令学徒守护兽麦丸追捕黑暗恶魔和他们所生的病毒。
中学2年生となった希は、監督に「新人戦の1回戦に出たい!」と何度も願う。 その理由は、対戦相手にあった。 一緒にサッカーを続け、小学4年生で転校していった、 幼馴染の“ナメック” 谷安昭がいる、江上西中学校なのだ。