《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起,以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物,红世之徒,戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说,故事会对第一季的一些伏笔作出解释,并加入不少这个时代的小故事。
大陆历一六零四年,在菲尔毕斯特大陆实际已经延续了三世纪的战国时代以北方霸主贾兹帝国的崩坏迎来了终结。投入的兵力包括正规的骑士及士兵,魔法师及乱破师,佣兵团在内实际六十二万,还包括航天要塞三座在内的大量魔法兵器,弃兽兵团,天龙骑兵队等特殊战力也毫无保留的被派出,彻底地将被称为“万恶的根源”的这个贾兹帝国歼灭。