地球物理学家田锁雄介博士（小林敬树饰）带领团队前往深海进行科学研究，但发现海底存在异常裂缝和泥流。经过一系列调查，他得出结论，日本列岛将在一年内沉没。然而，日本政府官员认为，Tanso博士的预测只是一个谎言，不值得相信。
昭和25年，山守组小头目三好万龟夫（菅原文太 饰）路袭敌对帮派头目，被判11年徒刑。服刑期间，随着日本经济的复苏和韩战的爆发，山守组不断壮大，而组织内部也分为山守、青木和难波三派。为壮大实力，三派先后拉拢三好，表面和谐之下暗流涌动。
镰刀“工匠”玛吉和她的“武器”灵魂，以最强的“工匠”为目标，开始了一场艰难的审判。同样有着相同目标的还有隐藏武器“工匠”黑星和“武器”吴纯，以及死神之子、死神德·基德和他的双胞胎武器姐妹。三组年轻男孩和女孩的成长故事伴随着“死亡武术专家”的危险。神秘的女巫美杜莎有着邪恶的头脑；死神一寸也不离开“死亡武馆”，似乎他也在隐瞒天大的秘密。
