从那时起，五年过去了。亚马逊几乎被驱逐，世界正在走向和平。然而，感染亚马逊细胞的普通人的亚马逊化现象继续扩大，政府成立了一个新的4C组织，秘密驱逐亚马逊化的人类。其中，童年时被亚马逊抚养长大并变身为假面骑士的年轻人亚马逊·尼奥对抗亚马逊。故事发生在圣阿斯马拉女子学校，在这里学习和生活的孩子都是出身高贵的孩子。我们的主人公是一个可爱的女孩，名叫牡丹（由松多里配音）。穆旦不是金汤匙生的女儿，只是一个很普通又有些大大咧咧的可爱女孩。
