《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历,人类正式开始进出宇宙2世纪,但因为2次大型陨石的坠下,人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年,第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。
在孤儿院长大的高中生樱井夕月(保志总一朗 配音)是个温柔的少年,但是有件事情一直困扰着他。夕月有一种特殊的能力,就是一旦接触对方,便能获知对方内心的想法,这让夕月感到十分痛苦,不知自己生存的意义何在。
她既紧张又渴望,谁知道她在等一堆漫画手稿,于是她愚蠢地成为了一名漫画助理。直到那时,千吉才意识到他心爱的野崎原来是一位著名的年轻漫画家。尽管这部作品以描绘一个年轻女孩的细腻思想而闻名,但野崎本人出乎意料地神经质,根本没有浪漫的经历。他的漫画人物原型来自他周围的朋友,这些“原型”都是对比度很高、很可爱的家伙。本剧是同名电视动画的特别版,故事仍然围绕着七位可爱主角的日常生活展开。