明海星树表面上看起来只是一个普通的学生,但事实上,他是这部漫画的原作者,连载作品发表在漫画周刊上。在一次意外中,幸树的真实身份被芦原寺的学生会长樱井静子(由樱井鸣人配音)发现。作为保守秘密的交换,兴树加入了学生会,学生会成员都是女性。
霧の総旗艦・ヤマトを目指していたイ401の艦長・千早群像は、父、翔像の生存を知ると、父との再会という新たな目的を抱き北極海へと向かう。一方、メンタルモデルとして成長してきたイオナは、自らの出自を告げられたことでその過去に苦しめられてしまう。
距离与维克特路基艾尔的决战已经过了一年,光(根岸拓哉 饰)结束了一年的海外进修,回到了日本。此时,咲夜(小池里奈饰)和玛娜(最上もが饰)也一起加入了UPG,组成了新生UPG。