来自冥王星的巨大陨石Tanatos(希腊神话)威胁着地球上人类的安全。为了对抗Tanatos,人类正以国际太阳系开发署(ISDA)为出发点,秘密实施之前未知的开发计划“D项目”。因为父母被调往了海外就职,不想跟着出去的相泽佑一(杉田智和 配音)寄宿到了阿姨水濑秋子和她女儿名雪家里。时隔七年,再次来到这个北国小镇的佑一本应有记忆点,可是真实的情况确是毫无记忆。在这个小镇,他邂逅了各色少女。