故事发生在未来世界,一种名为“巨大”的生命体凭空出现,将人类的命运带到了灭绝的边缘。此时此刻,世界各国联合起来发明了可以与庞格竞争的武器,而只使用这些武器的女孩名叫莉莉。大一新生杜苍碧在一次偶然的机会来到“Rainy Color”咖啡店工作。在那里,他遇到了冷酷英俊的岩濑清一、匆匆忙忙的樱木龙田、温柔女性的“Rainy color”刺客店主高贺白也,以及过度自由奔放的店主田木宏。