“B”其实是为了她的留言。“我在这里……”即使是身体变成了异形，黑羽也继续刻下无法传递的思念。基思和黑羽，两个未曾相见的人的命运终于被一个同样的阴谋卷在一起。
这支部队由中岛中将创建，旨在对抗现代大国的情报战，但零机构目前的任务是应对隐藏在东京的吸血鬼事件。被指派担任这项工作的人是最强的人类前田吉野，这个国家排名最高的吸血鬼，也是机制的新人黑井秀夫。他的智慧超乎寻常，从江户时代起就一直存在。他也是一个疯狂的科学家，喜欢他日渐衰老的大脑竹内。以上是零机构执行部队的成员。吸血鬼的数量越来越多，秘密行动的阴影，神秘的人造血液的存在，以及这些事件的冷眼观察者是S级吸血鬼Dave Roth，尽管他已经300多岁了，但他的外表与儿童相似。零机制今天，穿梭于大正的浪漫之夜。
三桥贵枝利用转学的机会，决定在新学校成为一名不良少年。为了在同学中获得存在感，他甚至去美发沙龙做了一头金色的卷发。和他转学到同一所学校的伊藤也有同样的想法。开学第一天，伊藤和三桥就发现了对方的秘密，于是结成了联盟。
