似乎从她们出生的那一天起，长崎46的女孩们就一直受到资深粉丝的批评。Naomizaka 46有一个专门的剧院，一个通过选举确定的单一阵容，并定期改变中心人物的位置，穿着水手服，像镜子里的AKB48一样蹦蹦跳跳，其重要性一度受到质疑。然而，通过女孩们的不懈努力，她们逐渐积累了自己的人气。在建军两周年之际，Naomizaka 46在武道博物馆举办了一场音乐会。之后，中心人物松井里奈与AKB48姊妹团体SKE48成员松井里娜进行了交流学习，引起了广泛关注和讨论。当然，在这个过程中，挫折和打击相互伴随，将欢笑、泪水和鲜血交织成了他们独特而无悔的青春
但天生快乐的小沃，在酒店里鬼小贩、美羊和灵鬼的鼓励下，努力招待每一位客人。这是一个温暖而快乐的女孩成长故事。
並由地球統合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後，在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當天，在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射，並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦！事已至如此頓時成了趕鴨子上架，不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰，並讓馬克羅斯升空啟航，以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥，並救起了一位名叫林明美的少女，且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛，卻也開始介入了戰事的發展之中，甚而成為主導後來歷史走向的契機……
