交大社会学系大四学生山本秋平（本木正弘饰）即将毕业，但该校毕业论文指导教授、相扑系顾问须山（下本明饰）找到了他，他说，除非他愿意加入大学的相扑系，否则他太逃学了，无法获得学分。
在令人吃惊的他们的身边被风吹到的“星巴邦”的地图，那是对天空之地“空岛”的地图。但是，突然天空突然出现了一个巨人的影子。摸索到空岛的路飞们在杰亚遇到了海贼勃朗峰·克里特。板球是400年前成为绘本的“骗子诺兰”的不光彩的探险家的子孙。但是，板球的祖先诺兰不是说谎，而是真的去了空岛。作为证据，路飞们知道了在航海日志中描绘的冲击的事实。然后，路飞们知道，作为去空岛的唯一线索，必须要被细菌海流吞噬。穿过强烈的海流的目的地，是在云上岛上存在的神之国·斯基亚。在喜悦的草帽一伙中出现了空之骑士·福尔和天空的居民科尼斯。但是，那里是被称为全能神的艾尔支配的国家…。 《海贼王》空岛特别篇将在富士电视台播出。本次特别篇将重制《海贼王》经典之章《空岛篇》，并加入全新的原创内容，将空岛篇扩展到2个小时的长度，“雷神”艾尼路将再次登场。
岛田学校的大规模暴行彻底粉碎了人类与寄生动物共存的观念。泉新一（井上大辅饰演）的生活发生了重大变化，他和柳美（桥本爱饰演）似乎也因这一事件而疏远。
