日本防卫省特种部队的精英内岛维辰（木佩·希娜饰）向学生们介绍了这种怪物。他拥有20马赫的超高速，人类的普通武器对他没有任何影响。为了防止怪物在一年后阴谋毁灭地球，人类必须想办法消灭他。而怪物自愿担任E班的班主任长达三年，因此无能为力的学生承担起了刺杀怪物的责任。之后，学生们接受了内岛的严格训练，刺客碧姬（Kei饰演）、智能机器人自主思考固定炮塔（桥本春奈饰演）、转学生森荷里（Kato Keishiro饰演）和教官秋原明（Takashima Masahiro饰演）等强大对手也纷纷来到这个暗杀教室，离奇的“杀害老师”将面临无休止的暗杀行动。。。这部电影改编自松井有政的流行漫画。
一次偶然的机会，海伦（海伦娜·博纳姆·卡特饰）和玛格丽特（艾玛·汤普森饰）认识了威尔克斯一家。在威尔克斯家族拥有的霍华德庄园中，玛格丽特和威尔克斯夫人（凡妮莎·雷德格雷夫饰）的关系最好。
