故事舞台在21世纪中期的东京,那时东京已经因为温暖化而被密林所覆盖,被骤雨与恐怖的热带蚊所威胁的人们建起了以希腊巨神阿特拉斯命名的高塔移迁到了空中。但是并不是所有的人类都拥有这样的福利,贫困的人们仍然得留在地面与种种危机为邻过着艰辛的生活。
二楼的木制公寓“Sakura sho”静静地矗立在安静的住宅区。公寓经理浅子是一位年轻美丽的寡妇。
公元2067年,以银河系边界星系为中心的“瓦尔”综合征由于自我的丧失和能力的极端破坏而逐渐扩大。意识到情况严重性的星际复合企业组织将女子“战术音乐组合Walküre”与“女武神部队”联合起来进行联合行动,以缓解这种症状。