西元1999年,一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船,之後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環境所造成的破壞(還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實),而組成了統合政府。
1945年,盟军突入德国,德国疯狂科学家李然博士研究的项目----科学怪人法兰克的心脏被潜艇秘密转移到了其同盟国日本的广岛陆军医院,供起研究出不死的士兵,然而核子爆炸使一切化为灰勁.十五年后,科学家在广岛研究核子放射能对人类还有环境的研究中,意外的发先了一个孩子,在检测 中发现其虽然受过核子放射能的照射,但一点都没有被污染,经过调查发现原来这个孩子在核子爆炸后迷一样的出现在广岛的英树医院(原广岛陆军医院),而且他还在不停的变大,所以科学家们推测当年的法兰克的心脏在受到了放射能的影响后,发生了异变,他们称其为广岛怪人法兰克.然而这时的法兰克已经变大到人们不可控制的地步,并且逃出了医院,另一方面,在秋田油田,出现了地底怪兽,最后两只巨大的生物在平原相遇,并进行了激烈的战斗,最后法兰克用火战胜了地底怪兽,然而与此同时一只大章鱼在悄悄的接近他.........
在经历了几次波折后,军事特工索尔贝(斋藤智郎配音)利用地球的龙珠将弗利萨带回了地球,而新复活的恶魔国王迅速启动了他的复仇计划。半年后,强大的弗利萨军队降临地球,悟饭(野泽雅子配音)、大魔王比克(久川实夫配音)、克林、天津饭和武田老师站了起来。孙悟空(野泽雅子配音)和贝吉塔(Horikawa Ryuki配音)跟随维斯(森田成一配音)在遥远的宇宙深处接受审判。在危机时刻,入侵地球的消息终于传到了韦斯和比鲁斯的耳朵里,悟空和贝吉塔即将与他们命中注定的敌人进行另一场对抗