新艺术家瑶瑶被深夜从家里传来的脚步声所困扰。他与灵魂研究者小田岛讨论了这个可怕的故事，小田岛是从电视综艺节目中认识的。虽然还不为人所知，但“怨恨”是基于实际发生的事件。在这个系列中，许多发生在“诅咒之家”源头的仇恨事件首次被揭露。
某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
