在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
流星雨从天而降，然后在眨眼之间，权力和巨额财富达到了最高水平。就这样，佐藤“温暖，有时严肃，同时又是后宫”的异国冒险故事展开了。
日本动漫《进击的巨人》的第二部是《进击中的巨人》。这是继《进击的巨人》第一部之后的连载动漫，将在《进击巨人》之后立即发展剧情。目前没有可用的动画版本。剧情简介：第二季告诉一个人类因被巨人捕食而崩溃的故事。
