上杉景虎原名北条氏秀，是北条氏康的七子，在北条与上杉家结盟这后被家人送到上杉家做上杉谦信的义子，必名为上杉景虎。1578年，上杉谦信病死景虎和上杉谦信的另一个养子上杉景胜之间展开了争夺家督继承权的战争史称“御馆之乱”。
三成美琴（石原龙美饰演）是一名在民间法医组织“UDI”工作的女法医，该组织专门接收因异常原因死亡的尸体，并对其进行解剖以查明案件真相。与美琴合作的还有法医中田实（井浦信饰演）、录音师京部龙郎（和田正雄饰演）和检验技师西子德海林（石川茂饰演）等。虽然中肠科有着丰富的临床经验，但其性格却古怪古怪。梅琴和中殿之间往往存在着不可调和的矛盾，它们对正义和法律有着不同的理解。事实上，中殿里有一个不为人知的秘密。他的女友不幸死于一场“意外”，但各种线索向纳夫透露，是一名连环杀手夺走了她的生命。中殿坚定不移地留在UDI，无所畏惧，正是为了找到杀害女友的凶手。
殊不知皇子化装为妇人，单人匹马潜入敌营，一举杀死熊曾族兄弟二人……
