一天，狮声像往常一样，在海滩上释放了他的信息素，却没有意识到一个神秘的女人在黑暗中偷偷盯着他看。这个神秘的女人给狮子音下药，使她变成了一个女孩。世隐绝望地想知道，他必须吸收男人的精华才能恢复男子气概，但如果他在恢复男子气概后失去了一定的精华，他就会再次成为女孩。很快，伊一就知道了狮音的秘密。出乎意料的是，这个愤怒的男人竟然为他的朋友流口水，而他的朋友已经成为了他的女儿。
可是父亲突然神秘失踪，因为联络不上父亲而担心的千鹤决定女扮男装前往京都探访。在那里，她所看见的是，与饥渴地寻求鲜血的妖怪所战斗并制伏他们的新选组的队士们。千鹤与新选组结下了奇妙缘分，并因缘际会之下加入了新选组。在搜索失踪父亲的主人公面前，出现了神秘的刺客们，逐渐明朗化地新选组的秘密——罗刹的存在。 在狂暴的时代中，在幕末争斗的背后,胸中挥舞着理想与信念之刃的男人们，与黑暗的战斗也拉开了序幕......
巧合的是，在月影岛的村长选举期间，柯南和其他人开始询问，以找到来到侦探办公室的发件人。为了寻找线索并参观岛上的公民大厅，麻生太郎的朋友月影岛的前村长桂山逝世三周年的仪式即将开始。于是柯南和他的团队发现了一架有年龄的钢琴。那架钢琴被称为麻生太郎去世当天音乐会上演奏的“被诅咒的钢琴”，甚至导致前村长桂山死亡。然后，仪式期间播放了《月光》的旋律，村里最大的资产川岛的溺水尸体被发现了，川岛是村长候选人之一。虽然是在室内发现的，但川岛的尸体是湿的，他的夹克漂浮在面向公民大厅的海里。因此，据推测，川岛是在面向市民大厅的大海中溺水身亡，后来被送往市民大厅。据此，柯南推断，这封信是一封杀人通知，有可能发生下一次谋杀。第二天，当政府机构与木木警察局和我们部门的其他人进行法律诉讼时，公民大厅的38名村民进行了调查。然而，这一次在政府机构的广播室里，现任村长黑岩被暗杀了，甚至在市民大厅里发现了Masao青梅竹马西本的上吊尸体。
