三成美琴（石原龙美饰演）是一名在民间法医组织“UDI”工作的女法医，该组织专门接收因异常原因死亡的尸体，并对其进行解剖以查明案件真相。与美琴合作的还有法医中田实（井浦信饰演）、录音师京部龙郎（和田正雄饰演）和检验技师西子德海林（石川茂饰演）等。虽然中肠科有着丰富的临床经验，但其性格却古怪古怪。梅琴和中殿之间往往存在着不可调和的矛盾，它们对正义和法律有着不同的理解。事实上，中殿里有一个不为人知的秘密。他的女友不幸死于一场“意外”，但各种线索向纳夫透露，是一名连环杀手夺走了她的生命。中殿坚定不移地留在UDI，无所畏惧，正是为了找到杀害女友的凶手。
在这紧要关头，人类组成宇宙舰队远征火星，结果几乎全军覆没，侥幸逃回的大和号成为人类最后的希望。与此同时，一个神秘装置穿越万里银河坠落地球，经检测发现该装置竟然能消除放射性物质。为了从装置的主人——麦哲伦星云伊斯坎达尔星的高智慧生物那里寻求帮助，人类决定孤注一掷，派遣大和号进行这次远征。火星之战中失去哥哥的原宇宙舰队成员古代进（木村拓哉 饰）应召归队，和一众好友成为了见证伟大历史时刻的一员。而得知人类动向的加米拉斯也发起了一波波的致命攻击…… 本片根据松本零士的同名原著改编。
