在经过了「女皇之刃 流浪的戰士」以及「女皇之刃 王位的繼承者」,第三季的动画已确定为「女皇之刃 叛乱」,这次的故事可是建基于「女皇之刃」原作的第二系列第一作「叛乱的骑士姬」,所以这次的主角将会是由骑士公主安妮洛特担任。
Masamu Shin(Kami Kazuya饰演)是一个非常普通的年轻人,从小就没有太多运气,总是被女人讨厌。一天,一个自称是神的人(山下正史饰演)出现在阿城面前。
卷毛是因为意外杀死了多次侵犯他的变态老师而被送到这里的,从此噩梦随之而来,而小舞是一个偏执狂,脱离现实。有一天,可可和卷毛沿着医院的围墙走向外面的世界。教堂里的赞美诗声让他们停下脚步,从一位好心的牧师那里收到了一本《圣经》。柯利相信世界末日即将到来,而可可觉得自己死亡的那一刻代表了世界末日的真实。之后,三人再次爬上医院的围墙,一起去等待世界末日。