一天,致力于研究化学中神秘物质X的Kazuki博士与他的助手和儿子Ken一起发现了一种新物质Z。这种物质在东京发射白光和黑光。这道白光击中了三个女孩,Aki Mura、Haodeshi Mura和Matsuhara Mura,她们是初中一年级的学生。结果,三名飞行女警官诞生了!!与此同时,黑光袭击了东京动物园。猴子山上的一只猴子成了飞行女警察的敌人。女警察将如何保卫这座城市
一夫和一美本是青梅竹馬的朋友,如今移居外地多年的一美回到故里成為轉校生,一段兩小無猜的感情眼看就要發生。只是神秘的事件讓一切都改變了,兩人正在發育的身體掉包,面對的身心困惑更是加倍。