在星奏学院里,学生被分为两类,一类是就读于普通科的平凡学生,另一类是就读于音乐科的能够看见音乐精灵的演奏天才。在一次偶然中,普通科的日野香穗子(高木礼子 配音)撞见了音乐精灵莉莉(水桥香织 配音)。很久以前,在无人居住的山区,建立了最新的人类研究中心。有一天,用于研究的主计算机突然意识到了这一点,并勃然大怒。人类不知疲倦地工作以防止暴乱并恢复和平。。。