为了防止犯罪团伙报复他，信义决定匿名并秘密追捕他们，希望能获得解药。有一天，新一的女友Maurilan来到阿里医生家，寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南，然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生，他们一起组织了一支青年侦探队，向罪犯宣战！
悲伤的爱德华和阿方斯兄弟试图用炼金术的最大禁忌——人体炼金术来拯救他们死去的母亲，但他们遭受了巨大的灾难。阿尔方斯失去了自己的身体，他的灵魂被盔甲囚禁，而爱德华则以右臂和左脚为代价，迫使他的弟弟停在黑社会的门口。
故事发生在名为“艾尔塔利亚”的都市之中，在那里，汇聚着来自世界各地价值连城的宝藏。收获祭即将拉开序幕，这盛大的庆典吸引了各地商人、游客前来参加，整个城市陷入了一片欢乐而躁动的海洋之中，据传说，祭奠当满，将出现流星缀满天空的壮观景象。
