为了报答自己的罪过,挽回失去的一切,兄弟俩踏上了寻找传说中的“哲人石”的旅程。几年后,一位右臂和左腿都被“机械盔甲”取代的国家炼金术士出现在人们面前。他被称为“钢铁的炼金术”。
回到故乡后,平太与已故好友俊介的未婚妻橘葵(竹内结子饰)重逢,橘葵一直希望溺死海中的未婚夫俊介能够回来,强烈的思念使她无法感受到平太的好感。有一天平太终于发现死人复活的秘密:“生者记忆不灭,死者便永存”。一直暗恋着橘葵的平太,心里虽有很大挣扎,但为了完成橘葵心愿,平太还是决定想办法让俊太复活。然而,复活只有三天期限,事实并非表面所见……