1989年,日本。乔纳森·乔斯达和迪欧决战一百年后,迪欧复活了。与此同时,约瑟夫的孙子近条太郎发现他有替身的能力,而迪欧的复活影响了对替身没有抵抗力的母亲,并陷入了危急状态;为了救他垂死的母亲,成太郎和约瑟夫出发前往DIO所在地——埃及。剧情紧接外传 Battlefield of Pacifist(和平主义者的战场),地球与殖民地的战斗于殖民后196年结束。除五飞外,希罗等四位高达驾驶员决心把高达送往太阳丢弃,然而统一的地球圈再次被人类的欲望所吞噬,战乱再一次燃起。