涌现出无数伟大魔术师的名门,阿诺德魔术学院。 少年雷伊·怀特,作为学院有史以来唯一一个普通家庭出身的魔术师,他的周围全是贵族或魔术师家族出身的同学们,因而遭受了严苛的视线。双子の姉妹エレインとダイアナは、生まれながらにして生体エネルギー“ヴァジュラ”の力を秘めていた。2人の精神が融合する時、超生命体“ジェノサイバー”が誕生した。 いま、ジェノサイバーと人類との半世紀にわたる戦いが始まる。