在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
托尼非常痴迷于各种语言，对汉字之美一直很向往，机缘巧合来到了日本，结果遇上了插画家纱织。一段异国恋就此展开。在恋爱的过程中，因为二人来自不同的国家，想法上有很多不同，但这不是矛盾，反而成为了二人进一步了解彼此的方法。在姐姐（国仲凉子 饰）的婚礼上，已同居的二人考虑到了结婚。但这似乎是一个麻烦的问题…… 本剧改编自小栗左多里的同名漫画，故事内容根据作者和其美籍爱人托尼的真实恋爱故事改编，充满动人的小情趣。
