为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!
故事发生在20世纪80年代,当时中学生三桥贵治(河濑贤治饰演)和伊藤真司(伊藤健太郎饰演)转到了一所新学校。为了显得更加阴险,他们不约而同地换了一个犯罪男孩的服装。刚开始上学,两个人意外击倒了十个人,并在一场战斗中成名。
这一次,主人公是一个名叫里希特的年轻人(由中岛直树配音),他使用了一把令人惊讶的长剑,并戴着面具来隐藏自己的真实身份。有一天,里希特遇到了一个叫Yonaga的年轻女孩(由Rina Honizumi配音)。阳菜听从母亲的遗言,踏上了寻找“暗杀之王”的旅程。从小在山里长大的羊才,不谙俗世,但也因为这种独特的天真,获得了意想不到的力量。