七年后，降龙重生为“新降龙”，一座绝对防御的城市。它以惊人的速度进化，成为人类对抗面临灭绝危险的B.R.A.I的最后一座希望堡垒。在命运的带领下，聚集在新降龙、雷昂、柯一、昆凌和道格。塞西尔、凯恩、杰伊和格伦欢迎他们加入国防军。于是，赌上人类生存的特种部队“潘多拉”诞生了。在签订合同时，希望寄托在他们身上--
乌丸大路顶着西瓜头，成绩优秀运动万能，可是看似完美的他却有着怪异的行为和只属于自己的秘密，身患绝症的他即将不久于人世。外表狂野个性粗暴的播磨拳儿（高桥广树 配音）内心有着柔软天真的一面，这一面的名字叫做天满，可是天然呆的天满似乎从未注意到过他的感情。当他鼓起勇气对天满表白时候，出现在眼前的女子，却是个性直爽的学院偶像泽近爱理（堀江由衣 配音）。面对播磨火辣的表白，泽近爱理的心里产生了异样的感情。 在矢神高中里，迷糊而快乐的校园生活每日都在上演。
直到神兵卫（下村隆饰）出现，他现在已经成为了一个流浪者，经过几次考虑，他终于同意了。他告诉农民们，至少需要七名战士，所以九藏（宫古京二饰）、圣四郎（木村功饰）、五郎（稻叶吉人饰）、七郎（加藤大辅饰）、平八（千木敏郎饰）和菊千代（三川敏郎饰。在整个防御准备过程中，武士和农民之间发生了许多摩擦和笑话。在一次偷袭中，一名武士为了救一名农民而被火器击毙。很快，山贼的反击随之而来，一场激烈的战斗即将开始。
