一场可怕的灾难席卷了整个世界,五年后,世界逐渐从废墟中恢复过来。所有的文化和技术都在慢慢复兴,包括3D全息成像技术的使用和舞台表演中“戏剧性现实系统”的使用。这种新兴的表演形式吸引了一群想要登台的年轻女孩。双子の姉妹エレインとダイアナは、生まれながらにして生体エネルギー“ヴァジュラ”の力を秘めていた。2人の精神が融合する時、超生命体“ジェノサイバー”が誕生した。 いま、ジェノサイバーと人類との半世紀にわたる戦いが始まる。