朝日重工的一名普通员工冈田格林朗(郎川大辅配音)在护送公司机密文件的旅途中,遭到一个名为黑岛商会的神秘组织的袭击和绑架,机密文件也被带走。为了确保机密不被泄露,朝日重工采取了删除行动,包括文件和冈岛绿人本人。这里的京城挂着白色的彩虹,随后又发生了各种各样的变故,人们被不安的心情所困扰。当时天皇朱雀帝因人心紊乱而心痛,天文学家加茂保宪下令解读中国秘传书金乌玉兔集,查明事件的原因。