《时代飞船》系列作品改编自去年播出的《时代飞船24》的世界观,以三个反派为主角。三大反派是指本作中的三个反派,他们通常伪装成世界上最大的教科书出版商“天国社会史”第14期仓库课程的成员。在这个世界上,有着能将妖精作为兵器所操使的“妖精兵”存在。战争结束后,他们结束了使命、失去了容身之处。战争后那不稳定的政局,因战争受到伤害的过去的犯罪者出现了,他们为了复仇而发动了恐怖袭击。