性格冷漠、对周围事物漠不关心的六条人晴(由直宫日惠配音)看起来可能是一个普通的高中生,但她的身体里蕴藏着忍者世界中最强的秘密技巧“森罗万向”。这种能力受到了忍者界许多人的觊觎,也吸引了伊加忍者部落的集体行动,发誓要带回仁清,揭开她体内的秘密。住在踯躅台的高中1年级生响裕太,某天醒来后失去了记忆。 之后,裕太与旧电脑里显现出来的“Hyper Agent·古立特”相遇了。 古立特告诉裕太“去完成使命”,而裕太则开始寻找这番话的意义以及自己的记忆。