史前人类和普通人类之间的种族战争已经达到了激烈的阶段。野村的首领死后，吉川（北村一宏饰演）、小田沙也（小田惠莉佳饰演）和濑户富如（鹿濑龙饰）聚集在未知的总部，思考J教授的真实身份。在一个阳光明媚的日子里，柯南（高山南配音）、小兰（山崎和加奈配音）以及少年侦探队的朋友们在毛利小五郎（也由小山立配音）的陪同下前往大阪，参加当地举行的“高中生高岳杯”百人一和声比赛。
