因此，具有特殊能力的“炼金术”被派往图书馆担任特务秘书，与转世作家作战，以对抗书中摧毁世界的“侵略者”，保护文学。
由于一场车祸，痴迷数学的博士（由寺井隆饰演）患上了奇怪的健忘症。从那时起，他只能保留80分钟的记忆。80分钟后，一切和人都像一个新的开始，所以他必须总是在身上贴上笔记，提醒自己一些重要的事情。当时，这位医生在哥哥的支持下去了英国学习。
2019年的一个夜晚，新东京郊外的封闭高速公路上，暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年，是一名叫做金 田的职业高中学生。 突然，街上出现了一位奇怪的矮个子男子，暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时，军队驾驶直升飞机赶到。将那位矮个男子与铁雄一起收押。 铁雄进入了一个陌生的地方，这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道，他们的未来，因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。
