第二天,柯南(高善男配音)和他的朋友们去东都水族馆观光,却发现了一个美丽的受伤女人(天海佑希配音)。这名妇女处于失忆状态,她的手机也被损坏,无法使用。柯南和其他人承诺会帮助她恢复记忆,但就在他们交谈的时候,隐藏在黑暗中的黑衣组织成员贝尔穆德(小山莫美配音)冷漠地看着这一切。在相处过程中,这个女人非凡的技巧和奇怪的言行让Ashikawara Ai(林惠美配音)质疑她的真实身份。刚才有一个平静的水族馆,那些沉浸在喜悦中的人会认为,随着神秘女子技能的恢复,他们很快就会卷入黑暗组织的杀戮和混乱中
在前任日本稻祖马率领的日本代表稻祖马赢得FFI世界锦标赛冠军十年后,松泽天马向往稻祖马十一人,如远藤,进入乐库农初中,并进入RAKUGO足球俱乐部。但当时足球踢得不好,也没有热门足球。天空突然陷入了一团盘旋的乌云之中。这是悲剧的开始。
本与加米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相助,向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸,并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下,地球防卫军利用伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。