作品描述身为班长（委员长）、并且拥有完美主义的主角「北神未海」，虽然暗恋着问题三人组之一的「东条潮」，却因为不断有人搅乱导致她至今无法告白。未海因为自己的事情搞的手忙脚乱，另一方面还要帮助其他人解决烦恼、并给他们完美的建议，《極上!!めちゃモテ委員長》就是描绘这些发生在主角周围大小事的高中校园作品。
在一片宁静的小山村，少女渡濑明日菜（金元寿子 配音）时常站在山顶，用父亲留给她的神秘矿石作二极管，收听着来自外面世界的美妙音乐。在一次放学途中，明日菜遭到一头怪兽的袭击，关键时刻她被俊美少年瞬（入野自由 配音）救下，纯洁的友谊在少男少女之间开始萌芽。明日菜体味着友谊的甜蜜，却不知瞬在某天悄然离开人世。新来的男老师森崎龙司（井上和彦 配音）为孩子们讲述了死国的传说，明日菜这才意识到瞬正是来自另一个世界雅戈泰的人。森崎真实身份隶属某个神秘组织，他和明日菜的心中都有想要复活的人，于是经过一波三折，他们随着瞬的弟弟心一同来到了传说中的雅戈泰。 在这个绝美而凄惶的国度，他们展开了似乎永无止境的旅程……
这个故事告诉了21世纪两位才华横溢的女高中生的故事，她们进入了一个生活受到麻将能力影响的时代。其中一位是一位名叫宫城长崎的年轻女孩，她每次都能打出正负0分的牌，而不会输赢。
