过去,在被称作冬木的城市曾举行过由七位魔术师与英灵参加的“圣杯战争”。 然而趁着第二次世界大战的混乱,“某位魔术师”强行夺走了圣杯—— 数十年过去,千界树一族高举那个圣杯为象征,叛离了魔术协会,宣布独立。故事发生在财羽大学的科学研究室,Ichikage Acorus(田裕功配音)和雪村心月(上田雄马配音)是在这里工作的两名研究生。有一天,令辛叶惊讶的是,她收到了菖蒲的供词。