灾难性袭击对世界造成“第二次冲击”后，世界在废墟上重建。14岁的Ikashi Shinji被他的父亲Ikashi Moto召集到第三新东京城。我以为我能看到他受到父亲的欢迎，但我看到一个名叫“使徒”的巨大生物与军队交火。
典子（黑木华饰演）是一名20岁的女大学生，她每天过着迷茫和漂泊的生活，对自己的未来充满困惑。在母亲的介绍下，Daiko和她的堂妹Mizuko（由多部裕子饰演）去了附近的茶道教室学习茶道。这是Daiko第一次进入这个陌生而神秘的领域。
在工厂工作的18岁少年「片桐真实」，由于中途辍学而遭受周围异样的眼光，为了争一口气，他与高中落榜的妹妹「真彩」一同前往不管是谁都能就读的「函授制高中」。
