2013年，一名来台湾学习旅行的女高中生肖兴喜被一种名为“进化入侵者”的突然怪物袭击。当军队完全无用时，神秘人作为超国家机构“DOGOO”的代理人出现在他们面前，继承了“伟大的灵魂”，并利用这一权力与“E基因持有者”作战。
Zi-O使用变身腰带“时空驱动器”，并装上变身道具“驾驭表头”变身。而且，能透过获得蕴藏着历代平成假面骑士力量的驾驭表头，将其力量解放，便能够穿上各平成骑士的装甲。这样，能够使用全部平成假面骑士力量的Zi-O，简直就是拥有从2000年开始“平成假面骑士”20部作品力量的超级英雄！自此，平成最后一位假面骑士的故事开始了。
一家日本大公司的首席执行官因突发心脏病去世。该公司唯一的合法继承人是一位名叫梅的女孩，当时她正在香港度假，对日本发生的事情一无所知。熊谷想收购公司已经很久了，这么好的机会怎么会被阿梅毁掉呢？如果阿梅没有在规定的时间内签署继承文件，她将失去继承资格。因此，熊谷派凶手到香港，千方百计阻挠阿美回国。艾米还没有意识到自己即将面临的灾难，她在香港遇到了业余歌手谭波（由谭咏麟饰演）和Looser乐队的一群成员，他们相处得非常愉快。很快，刺客抵达香港，对阿美发动了第一轮袭击。乐队的胖子向（陈百祥饰演）甚至被刺客抓住，要求他透露阿妹的下落。
