战争之后,日本被分为南北两个部分。美军统治下的青森县,少年藤泽浩纪和白川拓也都喜欢同年级的同学泽度佐由理。他们的心中都有佐由理,还有那个东西——边境以北的津轻海峡,日本北海道联盟建立的高耸云端的“塔”。
三岛由纪夫唯一的科幻小说,1962年发表的《美丽之星》将翻拍电影。小说讲述主人公因看到飞碟而认为自己和家人是从火星、木星等不同星球来的,因此要带领家人肩负起拯救地球的使命。
时间来到最终决战的两年后,在本应已迎来和平的地球上,怪兽们再度倾巢而出。 与此同时,世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT(精英胜利队)也迎来了新的队长——时冈(中村优一 饰),众人开启了调查。