珊璞和右京这两个情敌收到旅行社的邀请去旅游通过参考资料她们决定选择破恋洞游玩原因是进入破恋洞是传说进入里面的情侣一定会而感情破裂分手,为了破坏乱马和小茜两个人的感情他们邀请了乱马一群人,等大家到达洞口后假装不知道要情侣两人才能进入将乱马和小茜凑在一起让他们一起进入该洞,之后之后响良牙又和右京两个组队千方百计促使计划成功……
在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
