故事发生在一个虚构的世界中，人类受到兽人的支配，过着忍辱负重苟且偷生的日子。奇利艾（宫野真守 配音）是一个平凡的少年，某日，他看到了关于“世界毁灭委员会”的通缉令，没想到，本以为这一切和自己毫无关系的他竟然被卷入了一场充满了刺激与惊险的旅途之中。 莫璐特（坂本真绫 配音）正是“世界毁灭委员会”中的一员，拥有着能够毁灭世界的强大力量，命运让他和奇利艾相遇了，两人踏上了充满惊险和刺激的奇异旅程。托比（古谷彻 配音）是熊族兽人，机缘巧合之下亦加入了莫璐特和奇利艾的队伍中去，一路上，他们遇见了各种各样千奇百怪的旅人们，为这段本就不平凡的旅程增添了光彩。
这两个人正计划前往温德普岛偷走珍贵的钻石时钟，而金色梅里很可能被驻扎在岛上的扑克牌海盗集团偷走。不久后，他们遇到了扑克海盗队，但在第一次遭遇战中，他们被击败了，娜美甚至被另一支队伍带走了。为了取回飞船和同伴，以及获得钻石时钟，草帽海盗队和小偷兄弟相互对抗，向Windup岛前进。。。本片改编自日本漫画家小田荣一郎的同名原作，是2001年上映的第二部动画剧场版，由小田兼任作画监督。
