就读于穗群园学园的普通女孩伊利亚,某天遇到了自称是人造自然精灵的红宝石万花筒魔法杖,被迫签约成为魔法女孩伊利亚。此时,她是红宝石之星的持有者,并成为魔术师袁班琳的奴隶,袁班琳是万花筒之杖的原始持有者。在他的指挥下,她被迫帮助取回军衔卡。
这个世界里除了巨塔Artonelico和一些浮游大陆以外几乎什么都没有。整个Soul Shell就是一个完全封闭的空间,没有天空也没有海洋。在Soul Shell中存在着两大对立的势力,“艾尔米雷米尔教会”以及“天霸”。艾尔米雷米尔教会崇拜的是诗神,他们的目标是创造理想的国度,而天霸则掌握有极高的科学技术,他们目的则是建立科学化文明社会。 在Soul Shell中还有一个贯穿整个游戏剧情的种族,这个种族名为“雷瓦提尔”,这个种族拥有将思念转化为诗篇的强大力量……