2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
雷斯塔(冈本信彦 配音)是隶属于Oasis冒险团的道具师,某日,他受到了青梅竹马的好友卡丽娜(古山贵实子 配音)的邀请,来到了尚在建设之中的祭奠街道,在这里,两人偶遇了名为阿妮艾斯(水桥香织 配音)的街头艺人和名为切露西(今井麻美 配音)的神殿骑士,阿妮艾斯自称是排行世界第一的人偶师,而切露西则替盛典担任着警卫的职责。几人并不知道的是,当晚的流星将会彻底改变他们的命运。