为了对抗突然出现的人类敌人“尼禄”,世界各国组成了一支联合军队。但只有拥有特殊魔法的女孩才能对抗她们。由联合部队领导的柏林夺回行动终于开始了,第501联合作战航空团“对女巫的袭击”再次组建了一支军队。位于北海道的大夏邑农业高中(俗称夏邑农业中学)是一所寄宿制农业高中,学生大多以农业儿童为目标。新学年伊始,夏邑农业高中迎来了一位与众不同的学生——Yasuhisa Yongwu(木村良平配音)。